Η διαφορική διάγνωση είναι η διαδικασία κατά την οποία ο ιατρός εξετάζει και αποκλείει διάφορες πιθανές διαγνώσεις που εξηγούν τα συμπτώματα ενός ασθενούς, καταλήγοντας στην πιο πιθανή διάγνωση. Σε αυτή τη διαδικασία, γίνεται σύγκριση και ανάλυση των συμπτωμάτων, των κλινικών ευρημάτων και των αποτελεσμάτων εξετάσεων για να αποσαφηνιστεί ποια νόσος ή κατάσταση προκαλεί τα αναφερόμενα συμπτώματα.
Η διαφορική διάγνωση είναι απαραίτητη για την κατάλληλη διάγνωση και θεραπεία του ασθενούς και μπορεί να περιλαμβάνει εξετάσεις, ιστορικό, και αποκλεισμό ασθενειών με παρόμοια κλινική εικόνα.